《寓言传奇:黑暗吹笛人》故事发生的时间是19世纪末20世纪初，小镇哈默尔恩在节日庆典的时候被纪念主角吹笛人引导的老鼠攻击，5天之后侦探应邀来此侦查。故事就此展开。哈默尔恩是一个真实存在的城市，它位于德意志联邦共和国西北部下萨克森州威悉河畔。小镇历史悠久，也是吹笛人故事的发源地，彩衣吹笛人用笛声吸引老鼠结群跳河自杀之后却没拿到应有的报酬，于是用笛声吸引城镇的居民的孩子离家，并从此消失。但是这是格林兄弟笔下的童话，而这个游戏的主线是借了这个的皮，画的确实另一番景象。