《孤高娘》绝对机密情报的任务是潜入平常的学园里的卧底调查!?这个世界是由注重荣耀和武勋的「帝国」和惧怕其武力的好些个小国所组成。在接到终于发现邻国强敌「朱莱普利共和国」的军事训练设施所在的情报之后，高傲的军国少女「入谷少尉」和主角「黑须」，奉令潜入敌地施行谍报活动。这个凸凹拍档的间谍生存最后将会怎样!?计划潜入施行间谍活动的，不想竟至是“平常的”的学院!?重视光荣和功勋的「帝国」及畏惧其武力的小国组成的世界。收到谍报，发现邻国强敌「ジュラヴリ共和国」的军事训练设施，高傲的军国少女「入谷少尉」和主人公「黒须」受命潜入敌方进行间谍活动。不过潜入后，发觉这处怎么看都是一座及其平常的的学院!!2人作为共和国的学生「イリヤ」、「クロス」潜入调查。但是「入谷少尉」优秀的军人气质，再怎么谨慎也是麻烦不断。主人公因为这个焦头烂额。毎天晩上的加密无线通话内部实质意义只有诉说苦处和埋怨……然而学园自由又平和的时光，逐渐将「入谷」变成了「イリヤ」……这哼哈二将，何时才能结束其间谍生活呢?!