《秘密游戏2反叛》和一代作品有着类似的设定，在被周围的群山所包围的与外界隔绝的荒村--阿尾嵯（あおさ）村。那里堆积着腐朽的建筑，以及渺无人迹的废墟，在这个地方集合了14个年轻人，他们脖子上挂着安装了炸弹的项圈，每个人手里都拿着pda。他们没有选择，只能够参加这场“游戏”，“游戏”的规则，就是完成加给每个参加者的特定的条件。为了达到条件所有的行为也被正当化，连参加者之间的互相残杀也被允许了。如果不能达到条件，就会因为项圈爆炸而丧命。是为了活下去而相互合作呢。还是害怕背叛而孤身一人呢。还是……